据不完全统计，目前，我国有种子企业8000多家，是世界第二大种业市场，我国的育种研发通常采取国家出资、科研单位育种、种子公司经营的模式，部分种子企业产权不清，经营效率不高；同生物技术育种相比，一些地区常规的品种杂交选育比较普遍，育种周期长、效率低。同时，农村市场上没有商标、没有使用说明的种子还一定程度上存在。无论是育种者、生产者还是种子经营者缺乏产权保护意识，种子质量纠纷时有发生，市场监管难度大。
　　
　　种子产业的发展在我们国家越来越受到重视，《种子法》、《农作物种子生产经营许可管理办法》等法律、法规相继颁布实施，在实施的过程中也进行了修订，各级人民法院加强了对种子纠纷案件的审理，维护了种子市场秩序。
　　
　　依法行政作为一种宪政原则与行政管理模式，这一模式的建立与完善，对于市场经济的发展，对于行政管理改革的巩固与完善，都有重要的作用与意义。市场经济是一种法制经济，也是一种强调权利与义务对等的经济形态。依法行政作为公正的裁判，制定与维护社会普遍遵从的、以法律规范形式体现出来的各种“规则”，如公平竞争、等价交换、第三者权威仲裁等，实现在法律面前人人平等这一基本的法制规则。实现依法行政、公平行政，也就成为种业市场经济顺利发展的客观要求和保障。